More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0553 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  100 
 
 
494 aa  1004    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  46.65 
 
 
483 aa  432  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  50.86 
 
 
488 aa  430  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  48.62 
 
 
488 aa  426  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  44.11 
 
 
497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  46.14 
 
 
498 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  45.28 
 
 
497 aa  405  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  44.11 
 
 
498 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  46.79 
 
 
496 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  46.79 
 
 
496 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  46.79 
 
 
496 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  46.71 
 
 
506 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  43.4 
 
 
499 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  44.64 
 
 
498 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  44.97 
 
 
498 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  46.61 
 
 
505 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  42.77 
 
 
496 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  44.78 
 
 
502 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  45.4 
 
 
498 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  44.42 
 
 
507 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  43.68 
 
 
496 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  43.52 
 
 
501 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  43.04 
 
 
495 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
496 aa  388  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
495 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  43.31 
 
 
501 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  43.74 
 
 
501 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  42.83 
 
 
495 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  43.04 
 
 
495 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  43.04 
 
 
495 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  42.13 
 
 
498 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  42.34 
 
 
498 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  42.98 
 
 
498 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  42.34 
 
 
495 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  44.23 
 
 
499 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  41.67 
 
 
493 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  42.34 
 
 
500 aa  375  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  42.65 
 
 
504 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  44.49 
 
 
501 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  42.49 
 
 
494 aa  363  3e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  42.8 
 
 
493 aa  363  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  40.67 
 
 
504 aa  362  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
494 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  41.51 
 
 
503 aa  350  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  41.81 
 
 
504 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  43.61 
 
 
460 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  40.83 
 
 
444 aa  316  6e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  40.71 
 
 
448 aa  316  8e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  39.08 
 
 
456 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  39.78 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  39.96 
 
 
444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  38.63 
 
 
442 aa  310  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  37.39 
 
 
449 aa  306  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  40.04 
 
 
472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  37.91 
 
 
458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  40.26 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  39.78 
 
 
461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  37.5 
 
 
449 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  37.23 
 
 
456 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  38.46 
 
 
456 aa  302  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  37.5 
 
 
449 aa  302  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  37.17 
 
 
481 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  38.54 
 
 
460 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  40.13 
 
 
453 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  37.55 
 
 
460 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  40.13 
 
 
453 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  40.13 
 
 
453 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  40.13 
 
 
453 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  38.43 
 
 
460 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  40.13 
 
 
453 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  40.13 
 
 
453 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  40.13 
 
 
453 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  37.34 
 
 
460 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  37.96 
 
 
468 aa  300  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  38.41 
 
 
471 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  37.34 
 
 
460 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  38.21 
 
 
460 aa  299  6e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  39.69 
 
 
453 aa  299  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  39.69 
 
 
449 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  39.57 
 
 
441 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  38.7 
 
 
441 aa  296  4e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  37.53 
 
 
471 aa  296  7e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  38.59 
 
 
450 aa  296  7e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  38.96 
 
 
464 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  38.84 
 
 
445 aa  295  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  38.96 
 
 
464 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  38.11 
 
 
444 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  37.1 
 
 
454 aa  294  3e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  37.31 
 
 
444 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  37.44 
 
 
459 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  37.31 
 
 
439 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  38.48 
 
 
450 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  37.89 
 
 
444 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  38.13 
 
 
445 aa  293  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  37.86 
 
 
462 aa  293  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  38.35 
 
 
437 aa  293  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  38.82 
 
 
440 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  37.9 
 
 
462 aa  292  8e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  38.23 
 
 
472 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  37.8 
 
 
472 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>