More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1515 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  67.91 
 
 		 495 aa  677    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  86.55 
 
 		 499 aa  895    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  86.32 
 
 		 498 aa  887    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  80.04 
 
 		 501 aa  810    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  68.3 
 
 		 502 aa  690    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  69.88 
 
 		 498 aa  713    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  67.64 
 
 		 496 aa  682    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  85.92 
 
 		 498 aa  885    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  66.05 
 
 		 495 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  67.78 
 
 		 495 aa  676    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  68.44 
 
 		 498 aa  699    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  67.42 
 
 		 498 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  69.06 
 
 		 498 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  65.22 
 
 		 495 aa  650    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  68.4 
 
 		 496 aa  692    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  80.04 
 
 		 501 aa  811    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  80.04 
 
 		 501 aa  809    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  75.96 
 
 		 496 aa  774    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  65.84 
 
 		 495 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  66.74 
 
 		 500 aa  661    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  65.84 
 
 		 495 aa  662    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  100 
 
 		 498 aa  1025    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  67.76 
 
 		 497 aa  686    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  67.15 
 
 		 498 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  66.94 
 
 		 493 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  61.92 
 
 		 497 aa  613  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  57.08 
 
 		 506 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  54.9 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  55.31 
 
 		 496 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  54.9 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  52.97 
 
 		 505 aa  518  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  52.12 
 
 		 501 aa  501  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  53.57 
 
 		 499 aa  497  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  52.41 
 
 		 494 aa  493  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  52.75 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  52.45 
 
 		 507 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  51.99 
 
 		 494 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  46.94 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  50.94 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  49.69 
 
 		 503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  47.52 
 
 		 504 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  42.98 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  42.74 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  43.16 
 
 		 488 aa  372  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  39.63 
 
 		 483 aa  362  9e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  43.36 
 
 		 460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  40.34 
 
 		 442 aa  336  5e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  38.95 
 
 		 454 aa  327  4.0000000000000003e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  37.31 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  38.33 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  39.7 
 
 		 450 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  38.48 
 
 		 440 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  37.31 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  37.31 
 
 		 449 aa  320  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  37.1 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  37.1 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  37.1 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  37.1 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  37.1 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  37.1 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  37.1 
 
 		 453 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  40.34 
 
 		 446 aa  319  9e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  38.62 
 
 		 461 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  37.53 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  37.34 
 
 		 456 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  39.1 
 
 		 465 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  37.87 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  37.55 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  38.45 
 
 		 464 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  37.24 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  39.27 
 
 		 469 aa  312  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  39.02 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  38.03 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  38.03 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  37.84 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  37.45 
 
 		 445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  36.97 
 
 		 444 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  36.76 
 
 		 444 aa  309  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  37.08 
 
 		 464 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  38.46 
 
 		 465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  38.46 
 
 		 465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  37.55 
 
 		 468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  37 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  36.48 
 
 		 456 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  38.09 
 
 		 444 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  38.08 
 
 		 450 aa  306  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  37.84 
 
 		 465 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  38.84 
 
 		 472 aa  306  8.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  36.03 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  38.38 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  37.63 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  37.42 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  38.38 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  39.58 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  37.77 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  35.96 
 
 		 481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>