More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1928 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  83.72 
 
 		 506 aa  797    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  100 
 
 		 496 aa  999    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  67.66 
 
 		 501 aa  677    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  98.19 
 
 		 496 aa  984    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  74.8 
 
 		 505 aa  792    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  99.8 
 
 		 496 aa  998    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  73.59 
 
 		 499 aa  745    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  60.53 
 
 		 497 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  60 
 
 		 498 aa  579  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  61 
 
 		 497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  59.49 
 
 		 498 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  59.28 
 
 		 498 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  59.49 
 
 		 498 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  60.04 
 
 		 495 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  58.35 
 
 		 495 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  58.94 
 
 		 498 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  58.35 
 
 		 495 aa  555  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  58.56 
 
 		 495 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  58.14 
 
 		 495 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  58.85 
 
 		 496 aa  551  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  58.46 
 
 		 501 aa  551  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  58.21 
 
 		 493 aa  545  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  58.97 
 
 		 495 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  58.24 
 
 		 501 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  58.24 
 
 		 501 aa  547  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  58.76 
 
 		 496 aa  545  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  58.37 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  57.91 
 
 		 496 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  55.81 
 
 		 499 aa  538  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  54.8 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  54.9 
 
 		 498 aa  534  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  55.01 
 
 		 498 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  56.75 
 
 		 494 aa  532  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  53.63 
 
 		 500 aa  510  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  53.09 
 
 		 504 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  54.01 
 
 		 493 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  53.78 
 
 		 507 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  53.36 
 
 		 504 aa  475  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  50.3 
 
 		 503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  50.83 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  51.33 
 
 		 504 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  45.3 
 
 		 483 aa  405  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  46.79 
 
 		 494 aa  393  1e-108  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  45.36 
 
 		 488 aa  391  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  46.24 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  44.61 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  41.76 
 
 		 457 aa  342  7e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  41.76 
 
 		 457 aa  342  7e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  39.41 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  41.3 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  39.09 
 
 		 453 aa  329  7e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  38.27 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  38.27 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  38.27 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  39.41 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  38.67 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  38.27 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  38.27 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  38.27 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  38.46 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  38.07 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  39.66 
 
 		 456 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  39.41 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  40.46 
 
 		 465 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  39.84 
 
 		 462 aa  322  8e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  39.46 
 
 		 456 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  39.36 
 
 		 456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  41.19 
 
 		 472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  38.68 
 
 		 466 aa  320  5e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  40.04 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  40.04 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  38.41 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  38.41 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  38.38 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  38.6 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  37.45 
 
 		 448 aa  317  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  38.46 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  38.46 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  38.4 
 
 		 464 aa  316  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  37.69 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  41.65 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  38.89 
 
 		 481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  41.65 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  39.7 
 
 		 472 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  36.94 
 
 		 446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  37.74 
 
 		 476 aa  313  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  40.08 
 
 		 469 aa  313  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  37.63 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  38.62 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  39.83 
 
 		 463 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  39.66 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  38.51 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  39.45 
 
 		 467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  38.6 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  39.52 
 
 		 478 aa  310  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  38.33 
 
 		 458 aa  310  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  36.8 
 
 		 458 aa  309  8e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  39.66 
 
 		 468 aa  309  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  39.66 
 
 		 468 aa  309  9e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>