More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0734 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  86.55 
 
 		 498 aa  895    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  70.4 
 
 		 495 aa  681    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  87.55 
 
 		 498 aa  897    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  82.33 
 
 		 501 aa  837    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  66.39 
 
 		 495 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  71.22 
 
 		 498 aa  718    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  68.6 
 
 		 496 aa  686    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  68.63 
 
 		 493 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  70.19 
 
 		 495 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  82.33 
 
 		 501 aa  838    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  68.96 
 
 		 497 aa  685    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  66.74 
 
 		 495 aa  650    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  70.19 
 
 		 498 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  69.64 
 
 		 502 aa  703    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  67.7 
 
 		 498 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  66.74 
 
 		 495 aa  650    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  66.95 
 
 		 495 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  70.84 
 
 		 498 aa  720    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  69.17 
 
 		 496 aa  696    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  78.38 
 
 		 496 aa  778    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  81.93 
 
 		 501 aa  834    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  68.58 
 
 		 498 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  100 
 
 		 499 aa  1021    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  69.12 
 
 		 500 aa  669    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  87.35 
 
 		 498 aa  898    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  62.55 
 
 		 497 aa  613  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  55.81 
 
 		 496 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  55.81 
 
 		 496 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  55.39 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  56.44 
 
 		 506 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  53.59 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  54.49 
 
 		 493 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  54.94 
 
 		 499 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  54.27 
 
 		 494 aa  501  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  53.4 
 
 		 501 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  51.95 
 
 		 507 aa  478  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  49.37 
 
 		 504 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  51.23 
 
 		 503 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  51.78 
 
 		 494 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  50.31 
 
 		 504 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  49.27 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  43.4 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  44.07 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  43.64 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  40.7 
 
 		 483 aa  361  2e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  42.21 
 
 		 460 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  42 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  39.87 
 
 		 440 aa  329  7e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  39.02 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  40.87 
 
 		 469 aa  327  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  39.12 
 
 		 457 aa  326  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  39.12 
 
 		 457 aa  326  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  38.59 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  38.59 
 
 		 449 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  38.38 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  38.38 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  38.38 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  38.38 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  38.38 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  38.38 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  38.38 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  40.76 
 
 		 450 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  39.83 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  39.25 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  38.68 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  38.17 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  39.19 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  39.27 
 
 		 446 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  38.17 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  38.41 
 
 		 442 aa  318  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  38.17 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  38.28 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  39.1 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  38.43 
 
 		 454 aa  317  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  39.49 
 
 		 464 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  39.49 
 
 		 464 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  38.24 
 
 		 459 aa  316  6e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  38.33 
 
 		 442 aa  316  6e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  37.21 
 
 		 468 aa  315  8e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  38.3 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  39.28 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  39.27 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  39.45 
 
 		 465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  39.29 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  38.05 
 
 		 476 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  36.67 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  38.64 
 
 		 450 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  38.89 
 
 		 465 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  39.11 
 
 		 462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  37.55 
 
 		 456 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  38.87 
 
 		 470 aa  312  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  38.9 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  39.1 
 
 		 456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  38.12 
 
 		 473 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  37.34 
 
 		 456 aa  310  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  40 
 
 		 461 aa  310  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  37.87 
 
 		 445 aa  310  5e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  37.79 
 
 		 476 aa  310  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  36.6 
 
 		 481 aa  309  9e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  39.37 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>