More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1778 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  74.21 
 
 		 496 aa  774    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  74.8 
 
 		 496 aa  776    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  66.08 
 
 		 501 aa  678    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  77.62 
 
 		 506 aa  763    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  100 
 
 		 505 aa  1033    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  74.61 
 
 		 496 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  71.94 
 
 		 499 aa  709    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  59.01 
 
 		 497 aa  561  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  56.61 
 
 		 498 aa  551  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  56.38 
 
 		 497 aa  541  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  56.9 
 
 		 495 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  55.69 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  56.48 
 
 		 493 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  55.28 
 
 		 501 aa  534  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  56.36 
 
 		 495 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  56.36 
 
 		 495 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  54.99 
 
 		 495 aa  531  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  56.6 
 
 		 495 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  54.98 
 
 		 501 aa  529  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  54.98 
 
 		 501 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  55.77 
 
 		 498 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  55.34 
 
 		 498 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  54.78 
 
 		 498 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  56.03 
 
 		 496 aa  525  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  52.97 
 
 		 498 aa  518  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  54.68 
 
 		 498 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  54.53 
 
 		 494 aa  518  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  53.59 
 
 		 499 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  54.37 
 
 		 496 aa  511  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  51.99 
 
 		 498 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  52.41 
 
 		 498 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  55.11 
 
 		 502 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  53.3 
 
 		 496 aa  501  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  51.06 
 
 		 500 aa  494  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  54.55 
 
 		 493 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  50.59 
 
 		 504 aa  488  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  52.3 
 
 		 507 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  51.27 
 
 		 504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  49.5 
 
 		 503 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  50.63 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  51.05 
 
 		 504 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  43.9 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  45.47 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  46.61 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  44.33 
 
 		 488 aa  382  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  45.3 
 
 		 488 aa  382  1e-104  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  43.31 
 
 		 461 aa  349  8e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  41.03 
 
 		 457 aa  346  7e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  41.03 
 
 		 457 aa  346  7e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  40.04 
 
 		 476 aa  330  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  42.37 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  40.45 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  40.94 
 
 		 460 aa  326  6e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  39.53 
 
 		 448 aa  326  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  39.33 
 
 		 476 aa  326  6e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  41.23 
 
 		 472 aa  326  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  41.55 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  39.37 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  43.28 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  39.46 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  40.72 
 
 		 460 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  40.9 
 
 		 442 aa  323  6e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  40.46 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  38.94 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  39.04 
 
 		 470 aa  319  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  41 
 
 		 472 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  40.89 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  39.02 
 
 		 472 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  41 
 
 		 472 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  40.34 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  38.53 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  38.53 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  39.41 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  38.96 
 
 		 481 aa  316  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  39.66 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  40.63 
 
 		 469 aa  316  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  38.92 
 
 		 463 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  40.29 
 
 		 444 aa  317  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  39.36 
 
 		 456 aa  317  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  41.27 
 
 		 479 aa  315  9e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  40.55 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  40.21 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  39.36 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  38.98 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  39.83 
 
 		 473 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  40.55 
 
 		 468 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  40.13 
 
 		 471 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  40.13 
 
 		 471 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  40 
 
 		 464 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  40.13 
 
 		 471 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  40.13 
 
 		 471 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  40.13 
 
 		 471 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  39.19 
 
 		 471 aa  313  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  40.13 
 
 		 471 aa  313  6.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  40.13 
 
 		 471 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  40.13 
 
 		 468 aa  312  6.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  39.19 
 
 		 471 aa  313  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  40.13 
 
 		 471 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  40.46 
 
 		 469 aa  312  7.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  38.24 
 
 		 472 aa  312  9e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>