More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0142 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0142  replicative DNA helicase  100 
 
 		 504 aa  1011    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0766  replicative DNA helicase  69.23 
 
 		 503 aa  655    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  64.1 
 
 		 504 aa  611  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  51.11 
 
 		 497 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4412  replicative DNA helicase  51.34 
 
 		 495 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4306  replicative DNA helicase  51.34 
 
 		 495 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337711  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3938  replicative DNA helicase  51.34 
 
 		 495 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.19512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4633  replicative DNA helicase  51.13 
 
 		 495 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746602  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3494  replicative DNA helicase  50.83 
 
 		 498 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1928  replicative DNA helicase  51.33 
 
 		 496 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.671087  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1778  replicative DNA helicase  51.05 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0594772  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  50.42 
 
 		 506 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3808  replicative DNA helicase  50.41 
 
 		 502 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206642  normal  0.455208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0323  replicative DNA helicase  51.78 
 
 		 496 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2594  replicative DNA helicase  50.51 
 
 		 495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2290  replicative DNA helicase  51.88 
 
 		 498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0579  replicative DNA helicase  51.33 
 
 		 496 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2458  replicative DNA helicase  50.94 
 
 		 498 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5417  replicative DNA helicase  50.21 
 
 		 495 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0734  replicative DNA helicase  49.27 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00267216  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0490  replicative DNA helicase  46.49 
 
 		 500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0416  replicative DNA helicase  49.18 
 
 		 498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2991  replicative DNA helicase  50.21 
 
 		 498 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0456  replicative DNA helicase  49.06 
 
 		 501 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0450  replicative DNA helicase  49.06 
 
 		 501 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.741231  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2307  replicative DNA helicase  48.66 
 
 		 497 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.954316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2404  replicative DNA helicase  49.38 
 
 		 493 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.652213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0563  replicative DNA helicase  49.06 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1515  replicative DNA helicase  47.52 
 
 		 498 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2013  replicative DNA helicase  49.06 
 
 		 496 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0410  DnaB helicase  49.39 
 
 		 507 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0987  replicative DNA helicase  47.98 
 
 		 496 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326082  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  48.43 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1193  replicative DNA helicase  46.75 
 
 		 498 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0321974  normal  0.164958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1050  replicative DNA helicase  46.75 
 
 		 498 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  48.49 
 
 		 499 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1740  replicative DNA helicase  49.05 
 
 		 501 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.057325  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2508  replicative DNA helicase  49.38 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2873  replicative DNA helicase  49.9 
 
 		 494 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1848  replicative DNA helicase  46.96 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1209  replicative DNA helicase  46.57 
 
 		 494 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  41.81 
 
 		 494 aa  360  3e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  41.63 
 
 		 483 aa  358  1.9999999999999998e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  42.46 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  39.2 
 
 		 488 aa  342  1e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  39.45 
 
 		 488 aa  342  1e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  38.93 
 
 		 476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  38.93 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  39.79 
 
 		 461 aa  316  6e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  39.58 
 
 		 460 aa  315  8e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  39.58 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  38.88 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  38.88 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  37.63 
 
 		 463 aa  312  1e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  37.63 
 
 		 441 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  39.26 
 
 		 465 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  38 
 
 		 446 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  36.82 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  38.92 
 
 		 512 aa  306  8.000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  39.59 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  38.19 
 
 		 466 aa  304  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  38.19 
 
 		 466 aa  304  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  39.5 
 
 		 443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  37.78 
 
 		 466 aa  303  6.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  38.93 
 
 		 481 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  39.38 
 
 		 461 aa  302  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  38.99 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  38.99 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  38.99 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  38.99 
 
 		 453 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  38.11 
 
 		 448 aa  302  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  38.99 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  38.99 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  38.99 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  39.47 
 
 		 472 aa  301  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  38.57 
 
 		 453 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  38.91 
 
 		 449 aa  300  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  39.2 
 
 		 453 aa  300  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  36.97 
 
 		 471 aa  299  7e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  36.97 
 
 		 471 aa  299  7e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  36.96 
 
 		 472 aa  299  9e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  38.49 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  38.46 
 
 		 451 aa  297  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  39.83 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  38.46 
 
 		 451 aa  297  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  36.65 
 
 		 442 aa  296  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  38.46 
 
 		 459 aa  296  8e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  37.65 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  35.98 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  37.82 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  37.66 
 
 		 470 aa  295  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  38.24 
 
 		 464 aa  295  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  37.42 
 
 		 442 aa  293  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  37.11 
 
 		 463 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  37.24 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  37.45 
 
 		 454 aa  293  7e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  39.08 
 
 		 454 aa  293  7e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  38.19 
 
 		 450 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0535  replicative DNA helicase  34.17 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  38.32 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>