22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3667 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3667  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1049    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  44.67 
 
 		 512 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1283  AAA ATPase  37.57 
 
 		 392 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261303  normal  0.841625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  35.29 
 
 		 797 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2969  hypothetical protein  33.83 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4351  hypothetical protein  32.19 
 
 		 395 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2513  hypothetical protein  28.77 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  28.63 
 
 		 665 aa  57.4  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3494  hypothetical protein  27.75 
 
 		 404 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000189556  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  29.33 
 
 		 368 aa  50.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1388  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  32.12 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0749  DNA repair protein RadA  28.26 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.925672  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  27.32 
 
 		 756 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  26.18 
 
 		 292 aa  47.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7239  replicative DNA helicase  27.04 
 
 		 524 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.167922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  28.32 
 
 		 621 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  26.09 
 
 		 717 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  26.67 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  25.65 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0725  DNA repair protein RadA  27.37 
 
 		 441 aa  45.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.573014  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  24.72 
 
 		 382 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>