49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0396 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  100 
 
 		 358 aa  741    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  35.88 
 
 		 466 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  35.4 
 
 		 681 aa  212  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  35.4 
 
 		 681 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  36.14 
 
 		 678 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  36.18 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  40.16 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  32.26 
 
 		 421 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  31.54 
 
 		 647 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  27.81 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  33.62 
 
 		 375 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  32.36 
 
 		 756 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  31.93 
 
 		 590 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  30.9 
 
 		 387 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  30.87 
 
 		 569 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  27.02 
 
 		 679 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  26.49 
 
 		 717 aa  96.3  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  29.9 
 
 		 464 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  27.97 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  28.35 
 
 		 759 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  24.5 
 
 		 728 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  26.67 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  26.6 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  27.51 
 
 		 665 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  26.37 
 
 		 796 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  25.4 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  25.12 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  25.55 
 
 		 292 aa  57  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1854  hypothetical protein  23.65 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  hitchhiker  0.00705867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  25.55 
 
 		 667 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  24.89 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  26.11 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  36.99 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  23.27 
 
 		 640 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  26.38 
 
 		 741 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  27.08 
 
 		 712 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  26.74 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  27.08 
 
 		 712 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  27.08 
 
 		 712 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  27.08 
 
 		 712 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2962  hypothetical protein  22.75 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3071  hypothetical protein  22.75 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2918  hypothetical protein  22.75 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0543  hypothetical protein  22.82 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  25.79 
 
 		 587 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  23.61 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  25.99 
 
 		 716 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  25.67 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  22.22 
 
 		 654 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>