14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1854 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1854  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1057    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  hitchhiker  0.00705867 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  26.67 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  23.65 
 
 		 358 aa  54.7  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  25.68 
 
 		 590 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  26.15 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  27 
 
 		 362 aa  50.1  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  24.02 
 
 		 756 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.22 
 
 		 681 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.22 
 
 		 681 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  27.36 
 
 		 466 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  24.49 
 
 		 467 aa  44.3  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  24.49 
 
 		 467 aa  44.3  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  30.61 
 
 		 466 aa  43.5  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  21.93 
 
 		 482 aa  43.5  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>