29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1994 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  816    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  64.95 
 
 
728 aa  511  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  63.03 
 
 
759 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  62.96 
 
 
382 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  60 
 
 
454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  28.97 
 
 
590 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  31.03 
 
 
756 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  26.54 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  32.95 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  28.44 
 
 
717 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.85 
 
 
678 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  27.54 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  28.4 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.87 
 
 
681 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.22 
 
 
681 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  32.64 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  26.69 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  25.75 
 
 
375 aa  67  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  26.61 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  26.94 
 
 
569 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  23.71 
 
 
679 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  25.4 
 
 
358 aa  60.5  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  27.66 
 
 
647 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1886  hypothetical protein  29.09 
 
 
396 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  24.82 
 
 
654 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  37.66 
 
 
665 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  28.11 
 
 
667 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  31.52 
 
 
299 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3494  hypothetical protein  30.62 
 
 
404 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000189556  normal  0.0221167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>