53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6725 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  100 
 
 		 759 aa  1530    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  48.74 
 
 		 728 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  63.03 
 
 		 404 aa  479  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  54.55 
 
 		 454 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  54.43 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2965  hypothetical protein  39.51 
 
 		 440 aa  114  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3173  hypothetical protein  36.5 
 
 		 417 aa  109  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1647  hypothetical protein  38.41 
 
 		 851 aa  108  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  30.57 
 
 		 756 aa  107  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1346  hypothetical protein  44.8 
 
 		 793 aa  101  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  29.97 
 
 		 590 aa  100  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1690  hypothetical protein  29.39 
 
 		 370 aa  97.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1589  hypothetical protein  37.91 
 
 		 187 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.159507 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  30.97 
 
 		 717 aa  84.7  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  28.74 
 
 		 362 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  28.8 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.06 
 
 		 681 aa  82  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.06 
 
 		 681 aa  82  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  27.64 
 
 		 421 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  26.02 
 
 		 407 aa  80.5  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  26.76 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  32.8 
 
 		 770 aa  78.2  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.31 
 
 		 678 aa  78.2  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  31.84 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  36.42 
 
 		 848 aa  77  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  34.13 
 
 		 647 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4210  hypothetical protein  33.63 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  26.85 
 
 		 387 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  28.35 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  26.63 
 
 		 679 aa  72.4  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  25.52 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  33.97 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  34.64 
 
 		 751 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  28.68 
 
 		 569 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  31.46 
 
 		 857 aa  62.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0426  phage DNA-polymerase or DNA-primase  31.97 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  26.89 
 
 		 665 aa  57.4  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  27.98 
 
 		 654 aa  57  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  29.72 
 
 		 796 aa  54.3  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2163  hypothetical protein  40.32 
 
 		 189 aa  53.9  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  27.75 
 
 		 667 aa  50.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1658  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1172 aa  48.5  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.815472  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  41.33 
 
 		 389 aa  47.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  27.15 
 
 		 666 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  26.39 
 
 		 712 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  26.39 
 
 		 712 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  26.39 
 
 		 712 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  26.39 
 
 		 712 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  37 
 
 		 437 aa  46.6  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  28.06 
 
 		 718 aa  46.2  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  30.05 
 
 		 487 aa  45.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  30.62 
 
 		 621 aa  44.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1886  hypothetical protein  27.03 
 
 		 396 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>