17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3173 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3173  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  843    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1690  hypothetical protein  60.38 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2965  hypothetical protein  55.93 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4210  hypothetical protein  54.68 
 
 		 353 aa  335  7.999999999999999e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1647  hypothetical protein  44.19 
 
 		 851 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  37.81 
 
 		 770 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  32.58 
 
 		 774 aa  157  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  33.55 
 
 		 647 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  36.5 
 
 		 759 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0426  phage DNA-polymerase or DNA-primase  25.88 
 
 		 303 aa  92.8  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1589  hypothetical protein  38.93 
 
 		 187 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.159507 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  33.84 
 
 		 848 aa  89.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  38.1 
 
 		 728 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2163  hypothetical protein  36.54 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  29.61 
 
 		 751 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  30.66 
 
 		 857 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1658  hypothetical protein  34.97 
 
 		 1172 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.815472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>