22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1647 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1647  hypothetical protein  100 
 
 		 851 aa  1771    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1888  hypothetical protein  34.98 
 
 		 527 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1690  hypothetical protein  43.67 
 
 		 370 aa  267  5.999999999999999e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3173  hypothetical protein  44.19 
 
 		 417 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2965  hypothetical protein  37.46 
 
 		 440 aa  234  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4210  hypothetical protein  44.06 
 
 		 353 aa  214  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  39.19 
 
 		 774 aa  187  8e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  37.97 
 
 		 647 aa  160  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  35.39 
 
 		 770 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0630  DNA primase catalytic core domain protein  25.74 
 
 		 1026 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0772  DNA primase catalytic core domain protein  25.53 
 
 		 1026 aa  148  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1025  hypothetical protein  23.81 
 
 		 945 aa  147  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0592  hypothetical protein  22.74 
 
 		 945 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  37.93 
 
 		 759 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1589  hypothetical protein  35 
 
 		 187 aa  92.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.159507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  30.64 
 
 		 857 aa  87  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  32.72 
 
 		 728 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2163  hypothetical protein  36.84 
 
 		 189 aa  77.4  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  28.74 
 
 		 848 aa  76.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  31.95 
 
 		 751 aa  71.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0426  phage DNA-polymerase or DNA-primase  31.37 
 
 		 303 aa  63.9  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1658  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1172 aa  45.8  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.815472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>