18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1690 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1690  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  752    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3173  hypothetical protein  59.2 
 
 
417 aa  430  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2965  hypothetical protein  53.75 
 
 
440 aa  341  1e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4210  hypothetical protein  52.77 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1647  hypothetical protein  43 
 
 
851 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  38.56 
 
 
770 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  31.97 
 
 
774 aa  152  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  35.02 
 
 
647 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1589  hypothetical protein  35.26 
 
 
187 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.159507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  29.39 
 
 
759 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  31.69 
 
 
728 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0426  phage DNA-polymerase or DNA-primase  25.37 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  30.69 
 
 
751 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  31.77 
 
 
848 aa  79.7  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2163  hypothetical protein  31.95 
 
 
189 aa  64.7  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  27.84 
 
 
857 aa  63.5  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1658  hypothetical protein  29.7 
 
 
1172 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.815472  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0664  hypothetical protein  26.32 
 
 
166 aa  42.7  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>