48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3137 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  100 
 
 
647 aa  1348    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2965  hypothetical protein  35.64 
 
 
440 aa  157  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1647  hypothetical protein  37.71 
 
 
851 aa  157  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  33.7 
 
 
466 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  39.51 
 
 
681 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  39.51 
 
 
681 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  35.27 
 
 
774 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  37.6 
 
 
362 aa  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  38.68 
 
 
678 aa  143  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  33.54 
 
 
770 aa  139  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1690  hypothetical protein  35.02 
 
 
370 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3173  hypothetical protein  33.55 
 
 
417 aa  134  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  31.54 
 
 
358 aa  125  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  33.33 
 
 
367 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  35 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  30.54 
 
 
679 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  30.65 
 
 
464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  31.02 
 
 
590 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  31.72 
 
 
407 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  33.6 
 
 
421 aa  104  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  28.09 
 
 
756 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  30.8 
 
 
387 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1589  hypothetical protein  40.67 
 
 
187 aa  100  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.159507 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  32.55 
 
 
717 aa  99.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4210  hypothetical protein  33.21 
 
 
353 aa  94.7  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  29.31 
 
 
569 aa  87  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  24.6 
 
 
728 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2163  hypothetical protein  36.49 
 
 
189 aa  82.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  34.13 
 
 
759 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  28.97 
 
 
370 aa  76.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  26.37 
 
 
587 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  27.09 
 
 
666 aa  74.7  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  31.36 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  33.04 
 
 
437 aa  63.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  36.36 
 
 
751 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  30.65 
 
 
487 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  27.66 
 
 
404 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  26.63 
 
 
741 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  26.38 
 
 
654 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  25.58 
 
 
667 aa  54.7  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0426  phage DNA-polymerase or DNA-primase  25.93 
 
 
303 aa  54.7  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  29.08 
 
 
454 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  30 
 
 
857 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  25.37 
 
 
796 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  25.56 
 
 
665 aa  47.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  26.5 
 
 
299 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  22.28 
 
 
640 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  26.05 
 
 
841 aa  43.9  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>