44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1577 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  100 
 
 		 466 aa  962    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  56.05 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  55.29 
 
 		 681 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  55.69 
 
 		 678 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  55 
 
 		 681 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  43.93 
 
 		 367 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  82.79 
 
 		 711 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  35.88 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  71.54 
 
 		 605 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  37.5 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  33.7 
 
 		 647 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  37.13 
 
 		 590 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  34.11 
 
 		 375 aa  144  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  36.4 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  35.47 
 
 		 679 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  36.17 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  56.91 
 
 		 713 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  31.58 
 
 		 717 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  32.27 
 
 		 756 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  30.7 
 
 		 569 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  34.63 
 
 		 464 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  30.08 
 
 		 728 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  28.8 
 
 		 759 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  40.31 
 
 		 689 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  31.25 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  28.05 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  28.4 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  28.08 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  27.92 
 
 		 666 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  29.76 
 
 		 796 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  29.1 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  29.23 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  30.89 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  26.07 
 
 		 667 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  29.26 
 
 		 292 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  26.94 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  25.26 
 
 		 294 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  25.41 
 
 		 741 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2616  AAA ATPase  25.36 
 
 		 674 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  26.32 
 
 		 654 aa  47  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1854  hypothetical protein  27.36 
 
 		 515 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  hitchhiker  0.00705867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  29.38 
 
 		 665 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  27.74 
 
 		 325 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  29.17 
 
 		 487 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>