16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4351 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4351  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  795    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1283  AAA ATPase  52.19 
 
 		 392 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261303  normal  0.841625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2969  hypothetical protein  52.87 
 
 		 412 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  50 
 
 		 797 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  39.33 
 
 		 512 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3667  hypothetical protein  32.19 
 
 		 518 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2513  hypothetical protein  25.81 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450265 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1388  hypothetical protein  32.61 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  27.34 
 
 		 665 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  22.96 
 
 		 457 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  24.67 
 
 		 741 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  24.66 
 
 		 743 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  23.85 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  26.78 
 
 		 621 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  25 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  24.31 
 
 		 419 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>