63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4322 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4322  hypothetical protein  100 
 
 		 811 aa  1683    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  26.9 
 
 		 640 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  34.29 
 
 		 623 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  25.47 
 
 		 460 aa  56.2  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1695  hypothetical protein  27.06 
 
 		 415 aa  55.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385002  normal  0.0131506 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  22.68 
 
 		 718 aa  54.7  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  33.33 
 
 		 656 aa  53.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  27.74 
 
 		 445 aa  52.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3182  DNA repair protein RadA  27.09 
 
 		 465 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.540345 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1259  DNA primase  28.46 
 
 		 720 aa  51.6  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1543  DNA repair protein RadA  25.32 
 
 		 456 aa  50.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.456187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  31.13 
 
 		 616 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  29.91 
 
 		 629 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  30.17 
 
 		 667 aa  50.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  34.52 
 
 		 588 aa  50.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1432  DNA repair protein RadA  23.4 
 
 		 458 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  31.07 
 
 		 651 aa  50.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2309  DNA repair protein RadA  25.95 
 
 		 471 aa  49.3  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1125  DNA primase  31.82 
 
 		 716 aa  49.3  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  28.7 
 
 		 629 aa  49.3  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  25.62 
 
 		 456 aa  48.5  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  30.1 
 
 		 624 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0023  DNA repair protein RadA  20.56 
 
 		 444 aa  48.5  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0179797  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  22.51 
 
 		 452 aa  48.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  22.51 
 
 		 452 aa  48.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  20.7 
 
 		 368 aa  48.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1854  DNA repair protein RadA  24.38 
 
 		 443 aa  48.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  27.04 
 
 		 451 aa  47.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  27.15 
 
 		 454 aa  47.8  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  30.11 
 
 		 618 aa  47.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01611  DNA repair protein RadA  23.75 
 
 		 450 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.821199  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01501  DNA repair protein RadA  25 
 
 		 450 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.309187  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  27.03 
 
 		 448 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  31.78 
 
 		 616 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  23.53 
 
 		 443 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  23.64 
 
 		 451 aa  46.6  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1956  DNA repair protein RadA  25.79 
 
 		 455 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  24.53 
 
 		 465 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0135  DNA repair protein RadA  24.38 
 
 		 449 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  32.32 
 
 		 1172 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  28.7 
 
 		 656 aa  45.8  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0397  DNA primase  28.21 
 
 		 643 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  25 
 
 		 482 aa  45.8  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  24.31 
 
 		 583 aa  45.8  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  32.46 
 
 		 627 aa  45.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  21.77 
 
 		 453 aa  45.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  23.76 
 
 		 489 aa  45.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  30.71 
 
 		 588 aa  45.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  27.19 
 
 		 452 aa  45.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  30.28 
 
 		 1172 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2402  DNA repair protein RadA  24.68 
 
 		 489 aa  44.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  32.69 
 
 		 632 aa  45.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0864  DNA repair protein RadA  23.87 
 
 		 448 aa  45.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2504  DNA repair protein RadA  24.84 
 
 		 460 aa  44.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  30.63 
 
 		 642 aa  44.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  25.61 
 
 		 457 aa  44.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  21.86 
 
 		 462 aa  44.7  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26521  DNA repair protein RadA  24.7 
 
 		 464 aa  44.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  29.17 
 
 		 461 aa  44.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  25.68 
 
 		 457 aa  44.3  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  33.33 
 
 		 655 aa  44.3  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01521  DNA repair protein RadA  27.03 
 
 		 450 aa  44.3  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.268386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  20.62 
 
 		 476 aa  44.3  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>