More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1956 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1956  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 455 aa  913    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  71.3 
 
 		 453 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4092  DNA repair protein RadA  72.69 
 
 		 455 aa  634    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  55.92 
 
 		 467 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  56.36 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  57.46 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  57.24 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  58.44 
 
 		 474 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2291  DNA repair protein RadA  61.01 
 
 		 482 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.284518  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2015  DNA repair protein RadA  60.18 
 
 		 486 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.086129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2454  DNA repair protein RadA  61.59 
 
 		 483 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.819464  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3499  DNA repair protein RadA  61.12 
 
 		 485 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0406  DNA repair protein RadA  60.75 
 
 		 469 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1712  DNA repair protein RadA  56.14 
 
 		 455 aa  482  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.136365  normal  0.743682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3789  DNA repair protein RadA  61.77 
 
 		 499 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2995  DNA repair protein RadA  61.59 
 
 		 495 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  58.78 
 
 		 455 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  59.38 
 
 		 452 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  59.38 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1207  DNA repair protein RadA  58.41 
 
 		 458 aa  478  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  59.38 
 
 		 452 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2284  DNA repair protein RadA  60.6 
 
 		 503 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  57.33 
 
 		 476 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2597  DNA repair protein RadA  57.33 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  57.11 
 
 		 476 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  56.89 
 
 		 481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4631  DNA repair protein RadA  57.27 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.742671  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  56.48 
 
 		 457 aa  468  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2504  DNA repair protein RadA  59.35 
 
 		 460 aa  465  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1784  DNA repair protein RadA  57.74 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2309  DNA repair protein RadA  59.72 
 
 		 471 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  55.53 
 
 		 464 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2402  DNA repair protein RadA  58 
 
 		 489 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0415  DNA repair protein RadA  57.11 
 
 		 470 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  55.77 
 
 		 478 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  54.84 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  54.84 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3941  DNA repair protein RadA  57.71 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  51.26 
 
 		 450 aa  443  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0985  DNA repair protein RadA  57.21 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1850  DNA repair protein RadA  59.29 
 
 		 469 aa  440  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0403  DNA repair protein RadA  58.69 
 
 		 466 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0305  DNA repair protein RadA  48 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0698  DNA repair protein RadA  47.53 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  52.53 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  48.48 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0500  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.81715  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  48.58 
 
 		 482 aa  410  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  50.34 
 
 		 455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  47.92 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  50.68 
 
 		 453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  51.52 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  48.46 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0839  DNA repair protein RadA  49.01 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  49.31 
 
 		 451 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  47.47 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  48.86 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  47.9 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  46.68 
 
 		 476 aa  405  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  46.58 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  48.64 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  49.77 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  52.07 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  42.92 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  48.68 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 455 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  49.77 
 
 		 456 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  49.77 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  50.65 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  50.95 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  49.19 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  50.65 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  51.41 
 
 		 458 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  48.96 
 
 		 484 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  50.34 
 
 		 477 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  51.85 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  48.16 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  48.84 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  49.46 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  45.41 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1939  DNA repair protein RadA  51.2 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763295 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  49.88 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2602  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0200982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  49.33 
 
 		 449 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  51.69 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  46.06 
 
 		 481 aa  395  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6039  DNA repair protein RadA  51.63 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  50.47 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  51.2 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  49.88 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  49.22 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  46.61 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>