More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2629 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  53.79 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2173  methylation  49.65 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  42.86 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  43.41 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  42.64 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  45.9 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  43.09 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  42.64 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  41.86 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  34.68 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  41.03 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  44.53 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  39.1 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  69.57 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  37.5 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  52.24 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  37.19 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  35.88 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40.28 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  63.04 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.77 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  46.58 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  41.98 
 
 		 179 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  65.22 
 
 		 174 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  50 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  65.96 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.85 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  54.72 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.72 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  57.78 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  46.77 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3422  fimbrial protein pilin  42.5 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  62.22 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.78 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  50 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  63.64 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  46.38 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  58.82 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  76.32 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.78 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  69.23 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  57.14 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  39.6 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  49.21 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  35.51 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  52.54 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  44.59 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  37.8 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  44.93 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.78 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  38.46 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.27 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  37.39 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  40.15 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2019  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.46 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  49.18 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  46.67 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  49.18 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  45.76 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  39.24 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  49.3 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.16 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  44.44 
 
 		 188 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  41.11 
 
 		 199 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  43.24 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  32.84 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  41.43 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  50 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  52 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  48.39 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  48.39 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  48.39 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  32.87 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  47.76 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  48.39 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  47.62 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  64.1 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  62 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  50 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  50 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  50 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  50 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  50 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  50 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  51.92 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  58.14 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  39.19 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  50 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  38.14 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.33 
 
 		 168 aa  60.1  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  40.48 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  34.15 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  58.7 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  48.44 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  49.21 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>