157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0861 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  100 
 
 		 244 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  64.04 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  58.43 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  42.33 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  56.32 
 
 		 280 aa  92.8  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  39.49 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  39.61 
 
 		 287 aa  92  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  48.24 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  45.16 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  46.59 
 
 		 193 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  52.33 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  51.11 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  52.33 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  46.24 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  50 
 
 		 277 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  46.15 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  50.56 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  45.74 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  50.57 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  45.74 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  48.28 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  50.57 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  46.67 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  50 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  50 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  50 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  52.22 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  46.59 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  52.33 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  55.7 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  31.31 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  47.25 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  46.34 
 
 		 273 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  47.37 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  46.43 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  46.43 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  48.81 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  49.43 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  47.44 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  44.05 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  43.53 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  43.68 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  48.28 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  45.57 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  41.18 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  43.59 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  31.84 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  30.17 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  40 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  44.83 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  51.67 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  59.09 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  43.96 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  47.56 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  41.98 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  37.04 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  43.33 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  31.76 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  30.46 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  42.5 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  42.5 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  37.65 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  37.65 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  27 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  32.63 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  44.44 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  38.46 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  31.16 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  40.51 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  31.18 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  30.57 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  34.38 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  50 
 
 		 926 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  45.45 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  40.24 
 
 		 332 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  42.68 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  42.68 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  30.77 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  36.11 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1261 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  27.27 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  40.24 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  39.74 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  36.47 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  38.66 
 
 		 480 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  52.54 
 
 		 613 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  41.94 
 
 		 423 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  35.87 
 
 		 522 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  46.94 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  26.67 
 
 		 928 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  32.56 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  35.9 
 
 		 137 aa  48.9  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  52.54 
 
 		 611 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  52.54 
 
 		 611 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  28.14 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  35.53 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  35.06 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  39.02 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  39.24 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  37.97 
 
 		 443 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>