More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2344 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2344  response regulator receiver:protein phosphatase 2C-like  100 
 
 
409 aa  813    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  69.17 
 
 
421 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1126  response regulator receiver modulated serine phosphatase  49.01 
 
 
451 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6523  response regulator receiver modulated serine phosphatase  48.24 
 
 
422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.0636909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  46.75 
 
 
389 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0290  response regulator receiver modulated serine phosphatase  49.47 
 
 
390 aa  309  6.999999999999999e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.639758  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8460  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  48.04 
 
 
394 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0056  response regulator receiver modulated serine phosphatase  44.42 
 
 
418 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5361  response regulator receiver modulated serine phosphatase  47.64 
 
 
392 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155785  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  44.65 
 
 
395 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2688  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.29 
 
 
407 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2732  response regulator receiver protein  42.29 
 
 
407 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276002  normal  0.519614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2718  response regulator receiver protein  42.29 
 
 
407 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453118  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1576  response regulator receiver modulated serine phosphatase  43.3 
 
 
406 aa  249  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0296276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1263  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.64 
 
 
425 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.799731  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3268  response regulator receiver protein  41.93 
 
 
391 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22970  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  39.5 
 
 
423 aa  239  9e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2987  response regulator receiver protein  40.05 
 
 
391 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143541  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.09 
 
 
738 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 
634 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.68 
 
 
549 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
759 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  42.54 
 
 
746 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4150  response regulator receiver protein  48.23 
 
 
291 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0666389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
553 aa  93.6  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.05 
 
 
396 aa  92.8  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 
769 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
490 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 
682 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.72 
 
 
697 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 
874 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
492 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3357  response regulator receiver protein  45.1 
 
 
283 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 
500 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.7 
 
 
700 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4231  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.04 
 
 
357 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113145  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.72 
 
 
817 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  41.54 
 
 
492 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  41.54 
 
 
492 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  41.54 
 
 
492 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  41.54 
 
 
492 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  32.44 
 
 
693 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  35.48 
 
 
260 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.15 
 
 
637 aa  87  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  30.86 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.72 
 
 
728 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.35 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 
653 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.63 
 
 
847 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
386 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1869  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
553 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 
697 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
1248 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 
644 aa  83.2  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1521  protein serine/threonine phosphatase  29.69 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
647 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.19 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  35.29 
 
 
453 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1653  guanylate cyclase  38.89 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.66 
 
 
566 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.25 
 
 
549 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
1385 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  31.01 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  27.78 
 
 
1079 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  29.89 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.29 
 
 
479 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.64 
 
 
684 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.78 
 
 
564 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  33.71 
 
 
1432 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  26.5 
 
 
391 aa  79  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.59 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  31.44 
 
 
743 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.16 
 
 
672 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.15 
 
 
688 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  34.12 
 
 
772 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.73 
 
 
445 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  35.57 
 
 
685 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  28.62 
 
 
545 aa  77.4  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.9 
 
 
728 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.14 
 
 
1045 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  31.19 
 
 
570 aa  77  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  30.35 
 
 
688 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0583  response regulator receiver protein  24.43 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  29.81 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  28.31 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  32.81 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  29.45 
 
 
637 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  34.98 
 
 
562 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  50.67 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  50.67 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  50.67 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  32.56 
 
 
713 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.69 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  32.12 
 
 
574 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  31.36 
 
 
692 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  31.05 
 
 
800 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.5 
 
 
579 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>