More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4867 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4867  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 373 aa  758    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  60.94 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  59.07 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.67 
 
 		 392 aa  301  9e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.56 
 
 		 400 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.56 
 
 		 400 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  47.48 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001062  vibrioferrin decarboxylase protein PvsE  42.44 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01927  diaminopimelate decarboxylase  47.48 
 
 		 398 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3096  diaminopimelate decarboxylase  45.48 
 
 		 394 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0717  diaminopimelate decarboxylase  44.87 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0591874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.15 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  44.41 
 
 		 413 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09300  diaminopimelate decarboxylase  47.18 
 
 		 396 aa  265  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000620759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.1 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.79 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6954  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.01 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.41 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  38.73 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.85 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.94 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.15 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.51 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.59 
 
 		 428 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.29 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.59 
 
 		 431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4053  diaminopimelate decarboxylase  35.4 
 
 		 484 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  34.64 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0663  diaminopimelate decarboxylase  36.62 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.69 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.75 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  33.6 
 
 		 415 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.01 
 
 		 430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  33.95 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.01 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.94 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.37 
 
 		 412 aa  139  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.18 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.49 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.85 
 
 		 428 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.83 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.13 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.51 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.9 
 
 		 508 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  32.03 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.72 
 
 		 416 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.5 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2188  diaminopimelate decarboxylase  30.87 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.24 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  29.97 
 
 		 402 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  31.85 
 
 		 402 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.05 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  26.48 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  30.14 
 
 		 421 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2183  Diaminopimelate decarboxylase  28.27 
 
 		 412 aa  115  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  25.94 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  29.28 
 
 		 431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  29.78 
 
 		 425 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  29.76 
 
 		 427 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  28.11 
 
 		 407 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.31 
 
 		 440 aa  112  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  29.49 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  29.76 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  28.65 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  28.23 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  27.45 
 
 		 421 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  28.18 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  28.18 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  26.98 
 
 		 421 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  28.49 
 
 		 416 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1391  diaminopimelate decarboxylase  29.2 
 
 		 459 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  27.91 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4492  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  27.79 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.799972  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.08 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1204  diaminopimelate decarboxylase  28.83 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.313013  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  29.38 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  28.07 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1199  diaminopimelate decarboxylase  30.08 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0292186  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  28.99 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  30.71 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  26.7 
 
 		 419 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  26.08 
 
 		 417 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11811  diaminopimelate decarboxylase  25.58 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  28.3 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0477  diaminopimelate decarboxylase  23.68 
 
 		 430 aa  105  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  26.9 
 
 		 415 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  26.81 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1629  diaminopimelate decarboxylase  28.54 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11971  diaminopimelate decarboxylase  25.32 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.32 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  29.6 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  26.81 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  25.94 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  30 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  27.03 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  25.61 
 
 		 417 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  26.81 
 
 		 447 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  28.14 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09931  diaminopimelate decarboxylase  27.51 
 
 		 455 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  27.62 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>