More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1619 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  78.12 
 
 		 636 aa  1014    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 633 aa  1297    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  50.94 
 
 		 625 aa  623  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  50.63 
 
 		 625 aa  619  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  48.28 
 
 		 654 aa  565  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  47.58 
 
 		 630 aa  560  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  47.89 
 
 		 625 aa  559  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  46.64 
 
 		 611 aa  502  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  44.34 
 
 		 619 aa  500  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 659 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  40.26 
 
 		 620 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  37.93 
 
 		 633 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  37.34 
 
 		 634 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  38.13 
 
 		 634 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 		 626 aa  290  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 579 aa  118  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  24.15 
 
 		 577 aa  117  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 560 aa  112  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 		 608 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  23.23 
 
 		 645 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 557 aa  92.8  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 557 aa  91.7  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  32.4 
 
 		 518 aa  87  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 		 636 aa  86.7  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 559 aa  86.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  27.62 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.13 
 
 		 609 aa  79.7  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  36.75 
 
 		 561 aa  79  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  23.72 
 
 		 609 aa  77.4  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 604 aa  77  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 604 aa  77  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.82 
 
 		 564 aa  77  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 552 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 597 aa  73.9  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 559 aa  73.9  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  23.51 
 
 		 557 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 551 aa  72  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 576 aa  71.6  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  27.88 
 
 		 549 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.91 
 
 		 545 aa  70.9  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  34.72 
 
 		 560 aa  70.5  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  34.72 
 
 		 560 aa  70.5  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.43 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.47 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.93 
 
 		 588 aa  67  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 588 aa  67  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.74 
 
 		 534 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1565  oligopeptide-binding protein, putative  28.1 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.306093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 		 567 aa  65.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  21.92 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 536 aa  65.1  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.27 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  33.83 
 
 		 563 aa  63.9  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  22.61 
 
 		 627 aa  63.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  33.11 
 
 		 557 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  34 
 
 		 567 aa  63.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 		 565 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3874  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.31 
 
 		 585 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1060  ABC transporter substrate-binding protein  23.84 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.543795  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 579 aa  62  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 579 aa  61.6  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.38 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 544 aa  61.6  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.2 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  22.33 
 
 		 554 aa  60.8  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  31.65 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 		 636 aa  60.8  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11541  ABC transporter substrate-binding protein  23.4 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  30.33 
 
 		 568 aa  60.8  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  31.54 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 366 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  31.54 
 
 		 548 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11551  ABC transporter substrate-binding protein  22.94 
 
 		 523 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  22.27 
 
 		 537 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  30.7 
 
 		 562 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 521 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11401  ABC transporter substrate-binding protein  24 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  31.06 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  28.57 
 
 		 605 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3875  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.91 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  23.55 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.85 
 
 		 626 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.7 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.1 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  34.06 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.05 
 
 		 551 aa  58.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.24 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>