More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1120 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 711 aa  1437    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  40.45 
 
 		 771 aa  372  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  39.52 
 
 		 773 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  39.33 
 
 		 773 aa  369  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  37.52 
 
 		 772 aa  360  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  39.07 
 
 		 771 aa  360  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  38.29 
 
 		 795 aa  354  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  37.88 
 
 		 766 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  39.01 
 
 		 775 aa  346  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  36.39 
 
 		 789 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  35.84 
 
 		 655 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  37.35 
 
 		 789 aa  337  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  34.69 
 
 		 698 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  31.07 
 
 		 672 aa  314  2.9999999999999996e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  32 
 
 		 686 aa  221  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  30.53 
 
 		 668 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  31.29 
 
 		 731 aa  212  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  29.21 
 
 		 753 aa  211  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  32.31 
 
 		 677 aa  210  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  32.54 
 
 		 573 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  29.62 
 
 		 680 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  29.34 
 
 		 680 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  31.72 
 
 		 676 aa  194  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  24.2 
 
 		 640 aa  193  8e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.78 
 
 		 756 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 		 577 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 		 810 aa  109  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  29.85 
 
 		 699 aa  109  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.5 
 
 		 757 aa  106  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.37 
 
 		 754 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  38.01 
 
 		 578 aa  102  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.71 
 
 		 719 aa  102  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.42 
 
 		 732 aa  102  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.28 
 
 		 754 aa  101  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.82 
 
 		 806 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  25.87 
 
 		 718 aa  99.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.51 
 
 		 736 aa  99.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.74 
 
 		 738 aa  99.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.31 
 
 		 727 aa  99.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.46 
 
 		 801 aa  99  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.85 
 
 		 721 aa  99  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  31.12 
 
 		 570 aa  98.6  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  25.58 
 
 		 754 aa  98.2  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.36 
 
 		 769 aa  97.8  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  33.85 
 
 		 388 aa  97.8  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  23.92 
 
 		 703 aa  97.4  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  34.21 
 
 		 570 aa  97.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.47 
 
 		 731 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  26.21 
 
 		 713 aa  97.1  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  36.6 
 
 		 569 aa  96.7  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.16 
 
 		 742 aa  96.3  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  41.01 
 
 		 305 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.97 
 
 		 739 aa  95.9  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.26 
 
 		 754 aa  95.9  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  34.21 
 
 		 570 aa  96.3  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  34.21 
 
 		 570 aa  95.5  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.81 
 
 		 763 aa  95.5  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  33.48 
 
 		 459 aa  95.1  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  34.5 
 
 		 580 aa  95.1  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.76 
 
 		 804 aa  95.1  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  32.34 
 
 		 432 aa  95.1  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  32.6 
 
 		 363 aa  95.1  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.23 
 
 		 738 aa  95.1  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  26.67 
 
 		 781 aa  94.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  26.46 
 
 		 703 aa  94  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.49 
 
 		 704 aa  94  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.1 
 
 		 768 aa  93.2  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.8 
 
 		 730 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.99 
 
 		 754 aa  92.8  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  23.86 
 
 		 808 aa  92.8  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.82 
 
 		 772 aa  92  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  27.12 
 
 		 803 aa  91.3  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  24.15 
 
 		 722 aa  91.3  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  25.41 
 
 		 764 aa  90.9  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.15 
 
 		 731 aa  90.9  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.94 
 
 		 731 aa  90.5  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  38.06 
 
 		 367 aa  90.1  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.88 
 
 		 801 aa  90.5  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  24.42 
 
 		 763 aa  89.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.37 
 
 		 742 aa  89.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  25.52 
 
 		 788 aa  88.6  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.36 
 
 		 731 aa  87.8  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.99 
 
 		 723 aa  87.8  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  27.11 
 
 		 866 aa  87.8  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  41.13 
 
 		 652 aa  87.4  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.65 
 
 		 701 aa  87.8  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  40.28 
 
 		 617 aa  87.4  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  35.26 
 
 		 466 aa  87.4  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.92 
 
 		 718 aa  87  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.75 
 
 		 735 aa  87  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  33.79 
 
 		 744 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.99 
 
 		 757 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  37.82 
 
 		 442 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  28.37 
 
 		 776 aa  86.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.6 
 
 		 740 aa  86.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.18 
 
 		 698 aa  85.9  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.06 
 
 		 715 aa  86.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  33.97 
 
 		 662 aa  85.9  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  36.48 
 
 		 619 aa  85.1  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  31.15 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>