More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0847 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0847  twitching motility protein  100 
 
 		 370 aa  753    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.788432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1543  twitching motility protein  45.87 
 
 		 423 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3660  pilus retraction protein PilT  44.99 
 
 		 431 aa  299  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0637  twitching motility protein  45.92 
 
 		 412 aa  298  7e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3324  twitching motility protein  45.43 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2777  twitching motility protein  45.43 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2349  twitching motility protein  45.71 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06741  PilT2-like protein  43.87 
 
 		 423 aa  295  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0015  twitching motility protein  43.55 
 
 		 414 aa  292  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5029  twitching motility protein  44 
 
 		 428 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3606  twitching motility protein  42.51 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3449  twitching motility protein  42.51 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0548659  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  44.74 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0776  twitching motility protein  42.68 
 
 		 346 aa  262  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322077  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4672  twitching motility protein  41.38 
 
 		 429 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0871  putative protein transport, PilT-like  41.72 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  41.94 
 
 		 347 aa  259  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  41.64 
 
 		 347 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  41.64 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  42.17 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  40.87 
 
 		 360 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  41.98 
 
 		 347 aa  256  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  40 
 
 		 360 aa  255  9e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  41.92 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  39.94 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  41.95 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0761  twitching motility protein  41.54 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  41.23 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  40 
 
 		 363 aa  253  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  42.18 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  39.39 
 
 		 345 aa  253  6e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  42.48 
 
 		 345 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  42.43 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  40.59 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  38.42 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  40.35 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  41.32 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  40.71 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  40 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  41.32 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  41.32 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  40.12 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  42.01 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  41.67 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  42.01 
 
 		 345 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  41.32 
 
 		 345 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  41.32 
 
 		 345 aa  249  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  41.32 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  41.32 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  41.32 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  40.71 
 
 		 345 aa  248  8e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  40.52 
 
 		 356 aa  248  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  40.72 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1724  pilus retraction protein PilT  48.2 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  40.6 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  40.76 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  40.36 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  41.74 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  39.66 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  40.17 
 
 		 383 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  40.36 
 
 		 349 aa  247  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0831  twitching motility protein  43.83 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.859854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0833  twitching motility protein  43.83 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213742  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  40 
 
 		 344 aa  246  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  39.66 
 
 		 375 aa  246  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  40.47 
 
 		 347 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  41.14 
 
 		 358 aa  245  9e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  38.29 
 
 		 372 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  42.04 
 
 		 351 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  40.24 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  39.48 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  40.12 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  39.41 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1145  twitching motility protein PilT  38.86 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0148447  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  40.77 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  39.14 
 
 		 374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  40.77 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  39.53 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  39.71 
 
 		 344 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  40.12 
 
 		 345 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  40.22 
 
 		 437 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0998  putative type II/IV secretion system protein  38.98 
 
 		 373 aa  242  9e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  40.7 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  38.94 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  39.72 
 
 		 427 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  39.71 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  38.17 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  40.59 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4029  twitching motility protein  43.77 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.364781  hitchhiker  0.00141346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  39.94 
 
 		 344 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  39.07 
 
 		 349 aa  242  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  39.72 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  40 
 
 		 350 aa  240  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  40.62 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  36.94 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  39.07 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  39.07 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  39.43 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  39.39 
 
 		 427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  37.14 
 
 		 374 aa  240  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>