More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4513 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 341 aa  698    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  76.88 
 
 		 346 aa  532  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  34.28 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  31.2 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  30.41 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  31.83 
 
 		 376 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  31.17 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  32.52 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  33.69 
 
 		 372 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.06 
 
 		 373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  33.42 
 
 		 372 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  31 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  30 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  28.69 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  31.81 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  31.81 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  30.22 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  30.22 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  32.21 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  27.53 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  31.91 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  31.8 
 
 		 373 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  27.74 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  29.69 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  29.6 
 
 		 356 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  28.02 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  27.7 
 
 		 342 aa  93.2  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  27 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  27 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  27 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  27 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  26.59 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  26.49 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  27 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  26.59 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  26.36 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  26.36 
 
 		 350 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  32.86 
 
 		 363 aa  89.4  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  28.36 
 
 		 321 aa  89.4  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  26.79 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  26.35 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  26.35 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  25.46 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  26.35 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  26.07 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  26.07 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  26.07 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  25.79 
 
 		 369 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  27.87 
 
 		 324 aa  87  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  26.48 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  25.93 
 
 		 371 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  25.57 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  32.89 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  28.57 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  26.44 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  28.17 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  25 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  27.64 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  26.41 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  26.89 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  26.07 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  25.35 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  24.35 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  27.1 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  38.64 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  26.72 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  34.38 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.01 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  27.23 
 
 		 388 aa  67  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  33.87 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  29.41 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  29 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  35 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  30.2 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  35.51 
 
 		 533 aa  62.8  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  39.33 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  39.33 
 
 		 219 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  34.17 
 
 		 207 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  30.52 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  22.49 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.59 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  29.61 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  34.58 
 
 		 533 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  36.27 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  36.27 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  24.25 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  32.14 
 
 		 555 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  32.26 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  33.64 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6051  OmpA/MotB domain protein  38.03 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>