67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3691 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  100 
 
 
192 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  32.56 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3870  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  normal  0.416173 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  32.11 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  27.66 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  27.13 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  27.13 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  32.47 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004315  outer membrane protein A precursor  32.33 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  28.02 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  33.56 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  33.56 
 
 
376 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  30.2 
 
 
341 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  26.67 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  26.67 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  35.24 
 
 
377 aa  62.8  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1008  hypothetical protein  29.75 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000243922  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1138  OmpA-like transmembrane domain protein  29.11 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000563835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  32.88 
 
 
373 aa  60.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  29.08 
 
 
346 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  28.66 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  31.61 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  28.26 
 
 
188 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  32.17 
 
 
376 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  32.17 
 
 
373 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  35.96 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  27.17 
 
 
320 aa  54.7  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  28.12 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 
367 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0119  hypothetical protein  30.26 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  32.17 
 
 
367 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0254  hypothetical protein  29.84 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.941246  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  29.57 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3791  OmpA domain-containing protein  24.79 
 
 
144 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
365 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  31.9 
 
 
370 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  33.51 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  32.74 
 
 
366 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  26.22 
 
 
318 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  30.43 
 
 
368 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 
404 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1684  OmpA domain-containing protein  23.58 
 
 
184 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328252  normal  0.145136 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  31.86 
 
 
372 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  31.86 
 
 
372 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  29.91 
 
 
369 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  29.91 
 
 
363 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  31.86 
 
 
373 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  26.21 
 
 
321 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4843  OmpA domain-containing protein  30.92 
 
 
182 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  28.21 
 
 
204 aa  45.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  32.52 
 
 
331 aa  44.7  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  27.82 
 
 
356 aa  44.7  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  29.06 
 
 
369 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  29.06 
 
 
369 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  24.81 
 
 
369 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3428  outer membrane protein, putative  26.73 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0257  outer membrane protein, putative  30.08 
 
 
137 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0239703  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  28.65 
 
 
326 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1858  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  30.77 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00635914  normal  0.135318 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  29.17 
 
 
350 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  28.65 
 
 
321 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  26.81 
 
 
351 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  26.14 
 
 
367 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3022  putative outer membrane protein  25.75 
 
 
170 aa  41.2  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  25.68 
 
 
358 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  25.68 
 
 
369 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  25.68 
 
 
358 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>