63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2228 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  100 
 
 		 193 aa  381  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  38.46 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  40 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  40.51 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  40 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  41.33 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004315  outer membrane protein A precursor  41.45 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  40.1 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3791  OmpA domain-containing protein  45.97 
 
 		 144 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3870  OmpA domain-containing protein  37.31 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  normal  0.416173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0254  hypothetical protein  36.22 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.941246  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  28.02 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1858  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  27.78 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00635914  normal  0.135318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  31.73 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  28.72 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  28.72 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2709  OmpA-like transmembrane region  31.2 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.103983  normal  0.0521155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  28.72 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  29.19 
 
 		 318 aa  58.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1879  OmpA domain-containing protein  27.7 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  25.97 
 
 		 367 aa  54.7  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  28.05 
 
 		 320 aa  52.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0998  hypothetical protein  29.08 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  26.95 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4651  putative outer membrane protein  30.29 
 
 		 175 aa  52  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0980959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0119  hypothetical protein  27.48 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  26.67 
 
 		 367 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  26.25 
 
 		 387 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  26.57 
 
 		 373 aa  48.9  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  29.36 
 
 		 356 aa  48.5  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  28.93 
 
 		 357 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  28.93 
 
 		 353 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  28.93 
 
 		 353 aa  48.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  30.29 
 
 		 341 aa  47.8  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  24.37 
 
 		 369 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  27.05 
 
 		 373 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003547  hypothetical protein  32.37 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  26.49 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  21.63 
 
 		 404 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2541  OmpA domain-containing protein  25.6 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.480511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  30.08 
 
 		 2476 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1684  OmpA domain-containing protein  28.24 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328252  normal  0.145136 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  30.58 
 
 		 321 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  29.17 
 
 		 346 aa  45.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  26.57 
 
 		 372 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  26.57 
 
 		 372 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  26.84 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  26.53 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  24.74 
 
 		 377 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  29.6 
 
 		 321 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  27.05 
 
 		 358 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  29.81 
 
 		 355 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  24.49 
 
 		 376 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  27.12 
 
 		 366 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003546  hypothetical protein  25.43 
 
 		 171 aa  42  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  25.93 
 
 		 189 aa  42  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  30.43 
 
 		 355 aa  42  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  27.2 
 
 		 326 aa  41.6  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02500  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1171  hypothetical protein  24.55 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  29.63 
 
 		 3544 aa  41.2  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  30.23 
 
 		 373 aa  41.2  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  29.32 
 
 		 3699 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>