80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000691 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  100 
 
 		 204 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  30.37 
 
 		 354 aa  75.5  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1171  hypothetical protein  27.69 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  29.72 
 
 		 357 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  29.72 
 
 		 353 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  29.72 
 
 		 353 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  29.08 
 
 		 376 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  29.76 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  27.8 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  29.52 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  30.48 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  26.51 
 
 		 355 aa  61.6  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  29.86 
 
 		 371 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  29.91 
 
 		 351 aa  61.6  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  29.52 
 
 		 369 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  28.5 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  30 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  29.52 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  28.57 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  29.74 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  27 
 
 		 373 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  31.21 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 		 372 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 		 372 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  26.94 
 
 		 366 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  28.57 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  28.57 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  28.28 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  29.52 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  31.37 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  28.57 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  28.57 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  28.57 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  28.57 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  30.51 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  29.28 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  29.28 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  32.52 
 
 		 321 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000299  accessory colonization factor AcfA  25.97 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0418027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004315  outer membrane protein A precursor  30.56 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 		 366 aa  52  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  25.81 
 
 		 361 aa  52  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  30.07 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  24.22 
 
 		 346 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  27.46 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  28.95 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3810  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  28.84 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  28.3 
 
 		 367 aa  48.9  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  30 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  25.5 
 
 		 370 aa  48.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  29.68 
 
 		 367 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  28.21 
 
 		 334 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  24.42 
 
 		 341 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  26.49 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  27.8 
 
 		 404 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  28.21 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  26.26 
 
 		 321 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  26.97 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4451  outer membrane protein, putative  25.95 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  24.52 
 
 		 367 aa  45.1  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  26.97 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  24.34 
 
 		 363 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  28.14 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  26 
 
 		 330 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  24.34 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  27.18 
 
 		 320 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  24.74 
 
 		 356 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  42.31 
 
 		 284 aa  43.5  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  27.18 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  22.47 
 
 		 355 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3527  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  28.64 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4843  OmpA domain-containing protein  29.25 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0715  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  28.17 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  26.32 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  26.8 
 
 		 369 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  26.8 
 
 		 369 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  29.68 
 
 		 376 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  22.93 
 
 		 369 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3596  OmpA domain-containing protein  28.17 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.863386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>