62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01464 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  53.03 
 
 		 192 aa  215  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  53.54 
 
 		 192 aa  207  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  53.03 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  53.03 
 
 		 192 aa  205  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  56.06 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004315  outer membrane protein A precursor  53.54 
 
 		 187 aa  188  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3870  OmpA domain-containing protein  61.96 
 
 		 189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  normal  0.416173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3791  OmpA domain-containing protein  55.47 
 
 		 144 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  41.33 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  32.63 
 
 		 192 aa  91.7  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32.52 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  30.77 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  30.77 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  30.33 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  32.53 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  32.4 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  31.28 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  31.28 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  30.27 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  31.87 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1684  OmpA domain-containing protein  27.47 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328252  normal  0.145136 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  30.3 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  29.38 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  27.18 
 
 		 318 aa  62  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  34.93 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 366 aa  61.2  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  26.94 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0254  hypothetical protein  30.3 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.941246  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  29.41 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  28.34 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  27.67 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  30.41 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  27.5 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  29.26 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  27.41 
 
 		 373 aa  58.9  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  27.69 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1858  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  26.7 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00635914  normal  0.135318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  32.86 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  32.86 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  30.46 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  27.96 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1879  OmpA domain-containing protein  24.63 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  27.81 
 
 		 365 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  30.27 
 
 		 367 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  28 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 369 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 363 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  27.14 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4651  putative outer membrane protein  28.66 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0980959  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  26.84 
 
 		 321 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  24.04 
 
 		 404 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3810  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  27.83 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1138  OmpA-like transmembrane domain protein  25.43 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000563835  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  32.37 
 
 		 326 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4451  outer membrane protein, putative  27.65 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  34.1 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0413  outer membrane protein  27.12 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.43921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1008  hypothetical protein  25.77 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000243922  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1774  outer membrane protein  29.22 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000106277  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0823  OmpA domain-containing protein  26.62 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.961285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.81 
 
 		 236 aa  41.2  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>