50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1879 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1879  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2541  OmpA domain-containing protein  56.88 
 
 		 196 aa  191  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.480511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2709  OmpA-like transmembrane region  52.2 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.103983  normal  0.0521155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  32.24 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  30.45 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  33.77 
 
 		 376 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1171  hypothetical protein  27.33 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  28.5 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  28.3 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  27.62 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  27.49 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  27.49 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  27.62 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  26.42 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  27.54 
 
 		 354 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  27.54 
 
 		 365 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  26.96 
 
 		 346 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  26.96 
 
 		 346 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  26.96 
 
 		 346 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  26.96 
 
 		 346 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  26.96 
 
 		 346 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  26.83 
 
 		 350 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  26.53 
 
 		 356 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  26.62 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  27.27 
 
 		 351 aa  48.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  25.36 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1858  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  25.94 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00635914  normal  0.135318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  25.37 
 
 		 355 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2129  OmpA family protein  27.37 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  26.07 
 
 		 358 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2369  OmpA domain-containing protein  38.53 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.372044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2059  OmpA-like transmembrane region  32.32 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329594  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  25.12 
 
 		 353 aa  45.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  25.12 
 
 		 353 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  24.38 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  23.76 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  23.95 
 
 		 367 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  24.31 
 
 		 367 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  27.41 
 
 		 354 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  24.02 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  22.66 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  26.99 
 
 		 355 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  24.9 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  23.3 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  23.55 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  23.73 
 
 		 372 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  23.73 
 
 		 372 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  23.45 
 
 		 361 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  23.73 
 
 		 373 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  24.31 
 
 		 373 aa  41.6  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>