20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2129 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2129  OmpA family protein  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  90.5 
 
 		 179 aa  322  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2367  OmpA domain-containing protein  51.55 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0117742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2369  OmpA domain-containing protein  54.21 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.372044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2368  OmpA domain-containing protein  52.33 
 
 		 192 aa  167  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.175776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2366  hypothetical protein  47.67 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.613127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  30.81 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0230  OmpA domain-containing protein  30.77 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  32.52 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1879  OmpA domain-containing protein  28.06 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  31.74 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2691  OmpA domain-containing protein  32.5 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018652  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1171  hypothetical protein  28.31 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  29.48 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  29.48 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30.95 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  32.77 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2709  OmpA-like transmembrane region  28.83 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.103983  normal  0.0521155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3428  outer membrane protein, putative  27.49 
 
 		 181 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  28.89 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>