61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1909 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  78.8 
 
 		 184 aa  296  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  55.03 
 
 		 188 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  55.38 
 
 		 185 aa  211  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  55.38 
 
 		 185 aa  211  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  57.53 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  53.19 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  54.44 
 
 		 189 aa  177  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0257  outer membrane protein, putative  53.08 
 
 		 137 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0239703  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0623  OmpA domain-containing protein  39.27 
 
 		 190 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.196954 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0596  OmpA domain-containing protein  39.27 
 
 		 190 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0628  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  38.74 
 
 		 190 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3376  OmpA domain-containing protein  32.26 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0300762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4451  outer membrane protein, putative  34.97 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4843  OmpA domain-containing protein  32.47 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2691  OmpA domain-containing protein  30.27 
 
 		 176 aa  87.4  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018652  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3428  outer membrane protein, putative  32.43 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  27.8 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  33.72 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  31.98 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  30.65 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  28.1 
 
 		 318 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  26.49 
 
 		 373 aa  53.9  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  30.86 
 
 		 351 aa  52  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  31.18 
 
 		 354 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  31.18 
 
 		 346 aa  51.6  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  31.18 
 
 		 365 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  31.18 
 
 		 346 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  31.18 
 
 		 346 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  31.18 
 
 		 346 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  31.18 
 
 		 346 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  33.51 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  31.61 
 
 		 350 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2129  OmpA family protein  28.95 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424056 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  28.48 
 
 		 321 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  30.64 
 
 		 358 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  30.06 
 
 		 369 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  31.03 
 
 		 354 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  30.06 
 
 		 369 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  30.06 
 
 		 358 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  30.06 
 
 		 358 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  28 
 
 		 326 aa  48.5  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  30.68 
 
 		 371 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3182  outer membrane protein, putative  29.32 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  26.29 
 
 		 334 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  25.91 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  29.25 
 
 		 320 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  29.78 
 
 		 321 aa  45.1  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3008  hypothetical protein  29.09 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2036  hypothetical protein  26.4 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2369  OmpA domain-containing protein  27.32 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.372044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  27.47 
 
 		 361 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  24 
 
 		 330 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  26.64 
 
 		 358 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3870  OmpA domain-containing protein  29.52 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  normal  0.416173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  27.69 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003546  hypothetical protein  30.43 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  26.15 
 
 		 193 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  30.13 
 
 		 225 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  27.18 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  27.18 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>