26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0257 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0257  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 137 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0239703  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  87.6 
 
 		 185 aa  223  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  87.6 
 
 		 185 aa  223  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  87.6 
 
 		 188 aa  222  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  76.74 
 
 		 186 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  68.7 
 
 		 187 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  57.69 
 
 		 184 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  54.62 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  66.06 
 
 		 189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2691  OmpA domain-containing protein  29.85 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018652  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4843  OmpA domain-containing protein  40.35 
 
 		 182 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4451  outer membrane protein, putative  35.92 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3376  OmpA domain-containing protein  32.14 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0300762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0596  OmpA domain-containing protein  28.7 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0623  OmpA domain-containing protein  28.7 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.196954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0628  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  28.7 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3428  outer membrane protein, putative  34.38 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  35.16 
 
 		 321 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  35.71 
 
 		 318 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  30.08 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  30.15 
 
 		 320 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  36.26 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4651  putative outer membrane protein  29.84 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0980959  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  27.7 
 
 		 387 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  37.11 
 
 		 204 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3022  putative outer membrane protein  24.62 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>