18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0628 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0628  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0623  OmpA domain-containing protein  95.79 
 
 		 190 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.196954 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0596  OmpA domain-containing protein  95.79 
 
 		 190 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  38.74 
 
 		 184 aa  117  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  36.13 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  29.32 
 
 		 185 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  29.32 
 
 		 185 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  29.59 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.53 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  29.32 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  31.82 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2691  OmpA domain-containing protein  30.13 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018652  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0257  outer membrane protein, putative  28.7 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0239703  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4843  OmpA domain-containing protein  29.37 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3376  OmpA domain-containing protein  28.57 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0300762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  29.63 
 
 		 318 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3428  outer membrane protein, putative  26.92 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4451  outer membrane protein, putative  26.52 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>