57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0260 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  100 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  71.12 
 
 		 185 aa  268  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  71.12 
 
 		 185 aa  268  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  79.14 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  70.53 
 
 		 188 aa  259  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  57.98 
 
 		 184 aa  214  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  53.19 
 
 		 184 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  57.8 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0257  outer membrane protein, putative  68.7 
 
 		 137 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0239703  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4843  OmpA domain-containing protein  36.61 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4451  outer membrane protein, putative  36.25 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0623  OmpA domain-containing protein  29.53 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.196954 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0596  OmpA domain-containing protein  29.53 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0628  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.53 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2691  OmpA domain-containing protein  34.39 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018652  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3428  outer membrane protein, putative  32.97 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3376  OmpA domain-containing protein  29.41 
 
 		 177 aa  84.7  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0300762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  32.43 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  27.72 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  31.25 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  30.32 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.73 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  31.15 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  29.73 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  29.82 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  31.01 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  29.24 
 
 		 334 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  29.19 
 
 		 320 aa  48.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  30.41 
 
 		 377 aa  47.8  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  28.33 
 
 		 373 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  30.59 
 
 		 376 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  26.53 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004315  outer membrane protein A precursor  28.72 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  27.87 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  30.81 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  27.8 
 
 		 351 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3182  outer membrane protein, putative  28.86 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  26.37 
 
 		 358 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  26.37 
 
 		 358 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  26.37 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4651  putative outer membrane protein  31.25 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0980959  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  26.37 
 
 		 369 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  24.62 
 
 		 326 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  26.11 
 
 		 371 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3870  OmpA domain-containing protein  32.14 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  normal  0.416173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  28.43 
 
 		 367 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  26.74 
 
 		 330 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  27.78 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  26.77 
 
 		 354 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  27.32 
 
 		 211 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  26.77 
 
 		 346 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  26.77 
 
 		 365 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  26.77 
 
 		 346 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  26.77 
 
 		 346 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  30.43 
 
 		 179 aa  42  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  26.77 
 
 		 346 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  26.77 
 
 		 346 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>