19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3182 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3182  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3083  putative outer membrane protein  32.59 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.186031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0849  putative outer membrane protein  28.32 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1955  outer membrane protein, putative  31.32 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.077824  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2978  outer membrane protein, putative  30.24 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0242323  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  29.69 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  29.17 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1376  putative outer membrane protein  34.29 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2718  outer membrane protein  34.29 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.700569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  29.5 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  29.32 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0345  hypothetical protein  28.67 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  31.25 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  31.25 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  29.05 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  31.91 
 
 		 251 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  28.32 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2139  hypothetical protein  32.35 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.811527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  32.05 
 
 		 237 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>