53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0345 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0345  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  37.5 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1955  outer membrane protein, putative  41.04 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.077824  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0849  putative outer membrane protein  38.74 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2139  hypothetical protein  39.45 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.811527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1376  putative outer membrane protein  39.05 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2718  outer membrane protein  37.87 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.700569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0346  hypothetical protein  29.33 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2978  outer membrane protein, putative  36.52 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0242323  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0284  putative outer membrane protein  31.13 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  29.74 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  28.44 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  28.23 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  30.91 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  30.77 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  29.95 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3083  putative outer membrane protein  31.82 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.186031 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  28.42 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  28.44 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  28.04 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  29.11 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  29.05 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  28.57 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  27.45 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  28.92 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  27.45 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  30.77 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  24.87 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  27.75 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  26.85 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.67 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  25.25 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  27.36 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3182  outer membrane protein, putative  28.67 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  33.33 
 
 		 300 aa  46.2  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  25.12 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.08 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  28.96 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  26.46 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  31.76 
 
 		 254 aa  45.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5381  outer membrane insertion C-terminal signal  28.95 
 
 		 299 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0409917  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  26.95 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  25.24 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.75 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2464  hypothetical protein  27.16 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.541836  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  27.84 
 
 		 997 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  29.29 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4795  outer membrane insertion C-terminal signal  26.92 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.814191  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  25.47 
 
 		 240 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  27.27 
 
 		 452 aa  41.6  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5303  porin  28.65 
 
 		 299 aa  41.6  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  31.19 
 
 		 245 aa  41.6  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  25.64 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>