61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1955 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1955  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 207 aa  397  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.077824  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1376  putative outer membrane protein  48.47 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2718  outer membrane protein  48.47 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.700569  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  43.46 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2139  hypothetical protein  45.88 
 
 		 197 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.811527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0345  hypothetical protein  39.49 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2978  outer membrane protein, putative  39.2 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0242323  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0849  putative outer membrane protein  40.19 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0284  putative outer membrane protein  38.42 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  34.21 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0346  hypothetical protein  31.72 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3083  putative outer membrane protein  31.14 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.186031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  32.04 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  29.47 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  31.42 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  29.55 
 
 		 708 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  30.18 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  29.94 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  31.19 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  32.07 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  29.78 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  29.29 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3182  outer membrane protein, putative  33.33 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1247  hypothetical protein  30.54 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  31.03 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1284  hypothetical protein  30.54 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  28.5 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  30.77 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  26.57 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  33.17 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  28.7 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  28.5 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  30.39 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.85 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  34.29 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  31.34 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  31.25 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4129  putative outer membrane protein  29.73 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  28.04 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  30.43 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2620  OmpA domain-containing protein  28.92 
 
 		 170 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  31.09 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  31.51 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  27.06 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  27.06 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  27.08 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  27.27 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  26.5 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  25.26 
 
 		 997 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  29.09 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  27.89 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  32.54 
 
 		 452 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  31.61 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  29.38 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2080  putative outer-membrane protein precursor  30.43 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  29.05 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  28.5 
 
 		 238 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  27.75 
 
 		 234 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  30.06 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  28.3 
 
 		 243 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>