75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4129 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4129  putative outer membrane protein  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  30.08 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  29.17 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  29.96 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  29.55 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  28.28 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  27.42 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  27.27 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  28.4 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  26.36 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  27.1 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  28.77 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  29.82 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  26.89 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.96 
 
 		 236 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  29.76 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  29.95 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  27.19 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0849  putative outer membrane protein  32.79 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  29.95 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  28.51 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  25.9 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  29.37 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  29.95 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  27.42 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2139  hypothetical protein  30.77 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.811527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  26.19 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2334  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.51 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1303  hypothetical protein  33.59 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.13528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  29.55 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  26.89 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2464  hypothetical protein  27.78 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.541836  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3979  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.78 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  27.84 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1955  outer membrane protein, putative  32.07 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.077824  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  29.39 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  29.03 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  26.32 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1376  putative outer membrane protein  30.08 
 
 		 200 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  28.63 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  26.48 
 
 		 693 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1500  putative outer-membrane protein  29.68 
 
 		 218 aa  49.3  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2718  outer membrane protein  29.81 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.700569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  26.73 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  28 
 
 		 232 aa  48.9  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  25.35 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  22.62 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  28.44 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  25.74 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  27.73 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  30.29 
 
 		 724 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  25.66 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  30 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  23.28 
 
 		 562 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1437  hypothetical protein  31.43 
 
 		 223 aa  45.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  30.93 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  26.4 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0284  putative outer membrane protein  27.1 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.93 
 
 		 1186 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  29.48 
 
 		 452 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  29.81 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  40 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  26.04 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  27.73 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  29.78 
 
 		 213 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  22.68 
 
 		 559 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3008  hypothetical protein  35.21 
 
 		 172 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  26.34 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1092  membrane protein  28.57 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  25.45 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  26.87 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  23.44 
 
 		 561 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  25.78 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6718  hypothetical protein  29.93 
 
 		 550 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  28.33 
 
 		 997 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>