12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2620 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2620  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 170 aa  353  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3849  hypothetical protein  51.48 
 
 		 173 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0088  hypothetical protein  49.1 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100893  normal  0.732362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1955  outer membrane protein, putative  28.92 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.077824  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3008  hypothetical protein  30.19 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  32.08 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  28.57 
 
 		 354 aa  45.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.25 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2978  outer membrane protein, putative  30.05 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0242323  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  22.81 
 
 		 206 aa  41.6  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0849  putative outer membrane protein  26.83 
 
 		 199 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  24.85 
 
 		 206 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>