16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0346 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0346  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0345  hypothetical protein  31.95 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1955  outer membrane protein, putative  32.35 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.077824  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0849  putative outer membrane protein  29.95 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2718  outer membrane protein  30.72 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.700569  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  28.28 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1376  putative outer membrane protein  29.09 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  31.74 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2978  outer membrane protein, putative  26.02 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0242323  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  32.26 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2139  hypothetical protein  28.48 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.811527  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  29.94 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  27.92 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  26.27 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0284  putative outer membrane protein  26.09 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  47.17 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>