22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3376 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3376  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  354  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0300762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2691  OmpA domain-containing protein  50.85 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018652  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  35.14 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  35.14 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  35.14 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  32.26 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  32.45 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4843  OmpA domain-containing protein  32.78 
 
 		 182 aa  87.8  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  32.2 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  32.45 
 
 		 186 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4451  outer membrane protein, putative  31.21 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.41 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3428  outer membrane protein, putative  29.51 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0257  outer membrane protein, putative  32.14 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0239703  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0623  OmpA domain-containing protein  29.37 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.196954 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0596  OmpA domain-containing protein  29.37 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  32.09 
 
 		 321 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0628  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  28.57 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  26.02 
 
 		 355 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  25.27 
 
 		 318 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  33.04 
 
 		 334 aa  41.6  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  32.14 
 
 		 330 aa  40.8  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>