45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0265 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  83.24 
 
 		 185 aa  318  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  83.24 
 
 		 185 aa  318  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  80.32 
 
 		 188 aa  300  7.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  79.14 
 
 		 187 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  62.37 
 
 		 184 aa  227  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  57.53 
 
 		 184 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  58.12 
 
 		 189 aa  194  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0257  outer membrane protein, putative  76.74 
 
 		 137 aa  193  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0239703  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4451  outer membrane protein, putative  36.88 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4843  OmpA domain-containing protein  35.83 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3376  OmpA domain-containing protein  32.45 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0300762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2691  OmpA domain-containing protein  32.26 
 
 		 176 aa  94.7  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018652  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0596  OmpA domain-containing protein  29.32 
 
 		 190 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0623  OmpA domain-containing protein  29.32 
 
 		 190 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.196954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0628  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.32 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3428  outer membrane protein, putative  32.62 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  28.88 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  28.12 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  28.36 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  30.3 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  28.22 
 
 		 318 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  26.32 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  28.49 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  26.47 
 
 		 373 aa  44.7  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  27.93 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  29.7 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  25.91 
 
 		 326 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  38.16 
 
 		 377 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  28.43 
 
 		 371 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  27.86 
 
 		 358 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  27.86 
 
 		 358 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  27.86 
 
 		 369 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  27.86 
 
 		 369 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  28.43 
 
 		 367 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  27.44 
 
 		 321 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  26.67 
 
 		 334 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  25.41 
 
 		 192 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  25.41 
 
 		 192 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  25.41 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  27.81 
 
 		 250 aa  41.6  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  25.29 
 
 		 367 aa  41.2  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  26.37 
 
 		 358 aa  41.2  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  27.91 
 
 		 191 aa  40.8  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3182  outer membrane protein, putative  26.5 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>