29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3428 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3428  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4843  OmpA domain-containing protein  56.04 
 
 		 182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4451  outer membrane protein, putative  56.04 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  31.38 
 
 		 188 aa  84.3  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  34.95 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  32.43 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2691  OmpA domain-containing protein  31.15 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018652  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  33.12 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  33.53 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3376  OmpA domain-containing protein  29.51 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0300762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  32.62 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0257  outer membrane protein, putative  34.38 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0239703  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0596  OmpA domain-containing protein  27.56 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0623  OmpA domain-containing protein  27.56 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.196954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  27.54 
 
 		 351 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0254  hypothetical protein  29.86 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.941246  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  26.32 
 
 		 330 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0628  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  26.92 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  27.49 
 
 		 334 aa  45.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  26.73 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2129  OmpA family protein  27.97 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424056 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  26.34 
 
 		 321 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  26.83 
 
 		 355 aa  42  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  25.38 
 
 		 367 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  24.12 
 
 		 358 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  26.09 
 
 		 209 aa  40.8  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  26.35 
 
 		 204 aa  40.8  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>