20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2691 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2691  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  357  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018652  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3376  OmpA domain-containing protein  50.85 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0300762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  33.51 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  33.51 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  32.97 
 
 		 184 aa  98.2  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  31.38 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4843  OmpA domain-containing protein  34.05 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4451  outer membrane protein, putative  32.3 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  30.27 
 
 		 184 aa  87.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  34.39 
 
 		 187 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3428  outer membrane protein, putative  31.15 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  33.33 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  32.26 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0596  OmpA domain-containing protein  29.34 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0623  OmpA domain-containing protein  29.34 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.196954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0257  outer membrane protein, putative  29.85 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0239703  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0628  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  30.13 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  27.27 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2367  OmpA domain-containing protein  27.78 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0117742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2369  OmpA domain-containing protein  26.74 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.372044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>