20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2453 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2453  OmpA-like transmembrane region  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.19486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2129  OmpA family protein  90.5 
 
 		 213 aa  300  7.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424056 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2367  OmpA domain-containing protein  50.52 
 
 		 193 aa  175  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0117742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2369  OmpA domain-containing protein  52.36 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.372044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2368  OmpA domain-containing protein  50.78 
 
 		 192 aa  168  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.175776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2366  hypothetical protein  48.45 
 
 		 191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.613127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  31.98 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  31.48 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1879  OmpA domain-containing protein  26.42 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2691  OmpA domain-containing protein  27.27 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018652  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  31.58 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0230  OmpA domain-containing protein  28.93 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  29.31 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  29.31 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2709  OmpA-like transmembrane region  28.4 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.103983  normal  0.0521155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  32.18 
 
 		 225 aa  47.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1171  hypothetical protein  26.04 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  38.14 
 
 		 237 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  30.66 
 
 		 255 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  28.68 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>