38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4843 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4843  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4451  outer membrane protein, putative  79.12 
 
 		 182 aa  280  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3428  outer membrane protein, putative  56.04 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  35.9 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  37.04 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  37.04 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0260  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  37.04 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2691  OmpA domain-containing protein  34.05 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018652  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  34.07 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1909  OmpA domain-containing protein  32.47 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0905316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  35 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3376  OmpA domain-containing protein  32.78 
 
 		 177 aa  87.8  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0300762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0265  OmpA domain-containing protein  35.83 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0257  outer membrane protein, putative  35.94 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0239703  hitchhiker  0.00000101201 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0596  OmpA domain-containing protein  30.07 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0623  OmpA domain-containing protein  30.07 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.196954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0628  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.37 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  48.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1303  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.13528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  27.27 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  29.85 
 
 		 367 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  30.92 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  26.04 
 
 		 330 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  24.63 
 
 		 346 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  24.63 
 
 		 346 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  27.4 
 
 		 377 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  24.63 
 
 		 365 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  29.15 
 
 		 367 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  24.63 
 
 		 346 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  24.63 
 
 		 346 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  24.63 
 
 		 346 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  29.25 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  24.63 
 
 		 354 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  26.09 
 
 		 351 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  26.67 
 
 		 213 aa  42  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  26.63 
 
 		 334 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  25.32 
 
 		 320 aa  41.2  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  25.39 
 
 		 373 aa  40.8  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>