19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1303 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1303  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  358  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.13528  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3008  hypothetical protein  45.06 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2334  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  31.69 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4129  putative outer membrane protein  33.59 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  28.87 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  28.87 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4843  OmpA domain-containing protein  32.96 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4199  hypothetical protein  30.65 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1437  hypothetical protein  31.74 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3630  OmpA domain-containing protein  31.29 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00254639  hitchhiker  0.00108702 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  25.87 
 
 		 261 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  30.82 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3429  outer membrane protein, putative  31.25 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  31.68 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  27.47 
 
 		 229 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1500  putative outer-membrane protein  34.95 
 
 		 218 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  30.95 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  30.19 
 
 		 211 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  28.57 
 
 		 228 aa  41.2  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>